在污水采集過程中，所采集的水樣如果不能及時進行檢測必須放在避光陰涼的地方，防止灰塵與小蟲、小動物的進入，有條件的可放在冰箱內，以保持水樣的原狀。
儲存水樣的容器可能吸附待測組分，或者沾污水樣，因此要選擇性能穩定、雜質含量低的材料制作的容器。常用的容器材質有硼硅玻璃、石英、聚乙烯和聚四氟乙烯。其中石英和聚四氟乙烯雜質含量少，但價格昂貴，一般常規監測中廣泛使用聚乙烯和硼硅玻璃材質的容器。
不能及時完成分析的水樣，則應根據不同監測項目的要求，采取適宜的保存方法。水樣最長儲存時間一般為：清潔水樣為72h;輕污染水樣為48h;嚴重污染水樣為12h。保存水樣的方法有以下幾種。
(1)冷藏或冷凍法 冷藏或冷凍的作用是抑制微生物活動，減緩物理揮發和化學反應速度。
(2)加入化學試劑保存法
加入生物抑制劑
如在測定氨氮、硝酸鹽氮、化學需氧量的水樣中加入HgCl2，可抑制生物的氧化還原作用;對測定苯酚的水樣，用H3PO4調節pH為4時，加入適量Cu-SO4，即可抑制苯酚菌的分解活動。
調節pH值
測定金屬離子的水樣常用HNO3酸化至pH為1～2，既可防止重金屬離子水解沉淀，又可避免金屬被器壁吸附;測定氰化物或揮發性酚的水樣加入NaOH調節pH至12時，使之生成穩定的酚鹽等。
加入氧化劑或還原劑
如測定汞的水樣需加入HNO3(至pH<1)和K2CrO7(0.05%)，使汞保持高價態;測定硫化物的水樣，加入抗壞血酸，可以防止被氧化;測定溶解氧的水樣則需要加入少量硫酸錳和碘化鉀固定溶解氧(還原)等。
應當注意，加入的保存劑不應干擾以后的測定;保存劑的純度最好是優級的，還應做相應的空白實驗，對測定結果進行校正。水樣的儲存期限與多種因素有關，如組分的穩定性、濃度、水樣的污染程度等。表7-1列出我國《水質采樣》標準中建議的水樣保存方法。
